Arquitectura y Urbanismo Correcto Periodismo Letras Ingeniería Civil Educación Física Letras Letras de Libras Administración Ciencias Ambientales Artes visuales Enfermería Grado indígena Ciencias Biológicas Ingeniería Eléctrica Medicamento Ciencia de la computación Ciencias Sociales Farmacia Pedagogía Física Historia Relaciones Internacionales Fisioterapia Geografía Matemáticas Tecnología secretarial Teatro Química

La modalidad de posgrado, cuenta las siguientes maestrías y doctorados: Magíster Programa de Posgrado en Educación Programa de Posgrado en Derecho Ambiental y Políticas Públicas (PPGDAPP) Programa de Posgrado en Historia Programa de Posgrado en Letras Posgrado en Estudios de Teatro Contemporáneo Programa de Posgrado en Geografía Programa de Postgrado en Ciencias Farmacéuticas (PPGCF) Máster Profesional en Historia (PROFHISTÓRIA) Programa de Posgrado / Maestría en Desarrollo Regional (PPGMDR) Máster Profesional en Matemáticas (PROFMAT) Programa de Posgrado en Ciencias de la Salud (PPGCS) Programa de Posgrado en Ciencias Ambientales Programa de Postgrado en Estudios Fronterizos (PPGEF) Doctorados Programa de Posgrado en Biodiversidad Tropical (PPGBIO) Doctorado en Innovación Farmacéutica (PPGDIF) Red de Biodiversidad y Biotecnología de la Amazonía Legal (BIONORTE) Red Amazónica de Educación en Ciencias y Matemáticas (REAMEC)

La Universidad Federal de Amapá (UNIFAP), posee su sede principal en Macapá. Adicionalmente, se identifican sus campus en Santana, Oiapoque, Laranjal do Jari y Mazagão. Además, tiene un campus en construcción actualmente en Tartarugalzinho.